Pondok Pesantren Maqna’ul Ulum Sukorejo Sukowono Jember, merupakan Balai Pendidikan Islam yang dikembangkan untuk mencetak kader muda yang berakhlaqul karimah yang berjiwa keikhlasan, kemandirian, kesederhanaan, dan ukhuwah islamiyah.

Sistem pendidikan di Pondok Pesantren Maqna'ul Ulum mengenal dua istilah pendidikan. Yakni pendidikan Madrasiyah dan pendidikan Ma’hadiyah.

1. Pendidikan madrasiyah ialah sistem pendidikan klasikal yang dibagi menjadi beberapa jenjang, yakni

1. Madrasah Mu'allimin wal Mu'allimat al Islamiyah Diniyah.
2. SMP Maqna'ul Ulum.
3. SMK Maqna'ul Ulum Multimedia.

Dari semua tingkatan ini pelajarannya adalah kurikulum Dinas Pendidikan ( berafiliasi ke diknas ) ,kecuali Madrasah Mu'allimin wal Mu'allimat al Islamiyah (MMI) pelajarannya adalah kurikulum murni diniyah ( tidak berafiliasi ke diknas atau depag ).

2. Pendidikan Ma’hadiyah ialah pendidikan diluar kelas berupa pengajian kitab dan kegiatan2 ektrakurikuler lainnya